El síndrome de Bartter se considera en el diagnóstico diferencial de la alcalosis metabólica, la hipocalemia y la hipomagnesemia. La mayoría de los casos se diagnostican en la infancia con síntomas predominantes de poliuria y debilidad secundaria a hipocalemia. En algunos casos se produce retraso mental y del crecimiento. Una forma de diferenciar el síndrome de Bartter del síndrome de Cushing, el hiperaldosteronismo primario (síndrome de Conn) y el síndrome de Liddle es que los pacientes con síndrome de Bartter tienen una presión arterial normal a diferencia de los tres últimos que pueden presentarse con elevación de la presión arterial.

 En la insuficiencia renal aguda, el nivel de creatinina generalmente no aumenta más de 1,5 mg/día. Cualquier paciente que tenga un aumento más rápido de creatinina puede tener rabdomiólisis con liberación de grandes cantidades de creatinina del músculo esquelético.

 Solo unas pocas enfermedades conducen a insuficiencia renal crónica mientras se mantiene un tamaño de riñón normal a grande. En esta lista se incluyen la diabetes mellitus (DM), la amiloidosis, la nefropatía asociada al virus de la inmunodeficiencia humana (VIH-NAV) y otras enfermedades infiltrativas del riñón (p. ej., linfoma). La enfermedad renal poliquística (PKD) causa riñones marcadamente agrandados.